分子生物学新技术作业_分子生物学新技术
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名词解释:
Metabolomics:代谢组学是通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后),其代谢产物的变化或其随时间的变化,来研究生物体系的一门科学。
MicroRNA:miRNA是由21~25个核苷酸组成的非编码RNA;它通过与靶基因的3-UTR的配对,促进mRNA的降解或抑制mRNA的翻译从而抑制其靶基因的表达;它在生物体生长发育、细胞增值、分化、凋亡以及人类各种疾病等的发生发展过程中发挥重要的调控作用。
问答题
1.代谢组学的辅助研究手段有哪些,各有何特点?
(1)气相色谱-质谱联用技术 :特点:串联两个色谱柱,高分辨率、高灵敏度、高峰容量。
(2)液相色谱-质谱联用技术 :适用于短时间内选定靶标化合物的检测;UPLC相对于传统的HPLC有更好的分离效率、峰容量、及灵敏度,提供更适合与质谱联用的接口,有助于检出更多的代谢物。提高方法通量、灵敏度,改善与质谱联用的定性定量结果。UPLC与质谱联用为代谢组学研究提供更加高效、灵敏的研究平台。
(3)毛细管电泳-质谱联用技术 :以毛细管为分离通道, 采用高压直流电场为驱动力的的新型液相分离技术,通过离子化合物的质荷比(m/z)不同造成迁移速率不同来实现分离。适用于普通反相色谱柱不易保留的离子性代谢物的分离分析
(4)核磁共振技术:基于具有自旋性质的原子核在核外磁场的作用下,吸收射频辐射而产生的能级跃迁谱学。主要用于反应化合物结构中的H和C原子的位置信息。
2.MicroRNA的研究方法有哪些?
(1)miRNA基因芯片技术:高通量检测miRNA表达情况的最佳选择;(2)PAGE/Northern blotting杂交法:可用于miRNA表达水平的定量检测,还能与RNA marker结合使用检测miRNA分子的大小,用来排除其他小分子RNA的污染;(3)原位杂交:可直观显示生物体miRNA的时间和组织特异性表达谱;(4)miRNA实时定量PCR:可高度灵敏地检测出低丰度表达地靶分子,适用于高通量筛选。
3.举例探讨代谢组学在临床研究中有哪些应用?
药物研发,疾病研究,植物代谢组学,微生物代谢组学,中药现代化。如:应用实例:Yang Jun 等运用安捷伦公司的高效液相色谱系统配合API公司的Q-TRAPLC液相质谱系统。研究50个健康人和慢性乙肝病人的血清样本,经过脱蛋白处理。经过去噪音,峰型尖锐化等处理。使用PLS-DA处理代谢数据,研究确定了代谢物标记分子;微生物菌株细胞提取物的代谢分析(糖酵解,磷酸戊糖循环);2型糖尿病小分子丙酮醛修饰胰岛素检验诊断方案等。
4.谈谈MicroRNA与疾病相关性
MicroRNA与人类疾病包括肿瘤、糖尿病、炎症、心脏疾病、病毒感染等的发生密切相关。MicroRNA造成疾病发生的可能原因有:突变、基因表达失活、低效转录等原因造成的microRNA表达下调;启动子区域基因扩增或突变等原因造成的microRNA表达上调等。MicroRNA引发肿瘤的可能原因:(1)microRNA与细胞的增殖、分化、凋亡密切相关,而肿瘤则是由细胞增殖、分化、凋亡功能紊乱而引发的 ;(2)许多microRNA的基因位于基因组中易发生断裂、移位、缺失等变异的区域 ;(3)与正常组织相比,在恶性肿瘤和肿瘤细胞株中普遍存在着对microRNA的表达失控。MicroRNA引发糖尿病的可能原因:(1)MicroRNA参与胰岛素的合成分泌调节;(2)MicroRNA对血糖代谢起着直接或间接的调控作用;(3)MicroRNA与脂质代谢密切相关。