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2020-02-28 其他范文 下载本文

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1.生物体内哪些机制保证了DNA复制的保真性.DNA聚合酶的校对作用;RNA引物起始复制可减少复制错误;修复系统有多种机制(光修复、切除修复、错配修复、易错修复、SOS修复)和酶。

2.有一个被认为是mRNA的核苷酸序列,长3000个碱基,你怎样才能;(1)证明此RNA是mRNA而不是tRNA或rRNA(2)确定它是真核还是原核mRNA.答:①使用oligo DT,对这个RNA做反转录,如果获得相应的cDNA,那这个序列就是真核mRNA,因为真核mRNA的末端的具polyA尾巴可以和oligoDT互补。否则可能是tRNA,rRNA或原核mRNA。②在被侧序列的5'和3'端分别加上特异的寡聚接头并用RNA酶连接,以5'端特异寡聚接头设计的引物及3'端特异接头序列扩增被测序列。测序并进行序列比对分析鉴定其是否有SD序列,如果具有SD序列则为原核mRNA.3.真核生物组蛋白修饰有哪些?以目前的研究成果,在活跃转录的基因启动子区哪种组蛋白修饰最常见?

真核生物组蛋白修饰有:甲基化、乙酰化、酰胺化,以及对应的去掉这些修饰的去乙酰化、去甲基化等。

最常见的是乙酰化,乙酰化中和了组蛋白尾巴的正电荷,降低了它与DNA的亲和性,导致核小体构象发生有利于转录调节蛋白与染色质相结合的变化,从而提高了基因转录的活性。

4.说明真核生物表达调控的不同层次。并请说明最重要的调控环节

(1)DNA和染色体水平:基因重排、基因扩增、DNA修饰、基因封闭、核小体的修饰(染色体结构)。

(2)转录水平:包括转录起始、延伸的弱化、终止都会对mRNA前体水平产生影响。

(3)转录后水平:真核生物转录和翻译不偶联,转录出的mRNA前提经加工才能成熟为翻译模板mRNA,此过程包括剪切、修饰、编辑、5'和3'端的修饰及转运到翻译场所等。

(4)翻译水平:包括核糖体的磷酸化/去磷酸化调节,poly(A)的调节,移码和通读等。

(5)翻译后水平:包括翻译产物的剪切、修饰(如糖基化、磷酸化、切除信号肽、脂化及构象形成、转运和装配形成复合蛋白体)

(6)mRNA降解的调控,随生长发育和外界环境改变、细胞中蛋白质种类也在不断变化,原有mRNA要降解并以新mRNA代之,因此mRNA是有一定寿命的,细胞中有控制mRNA寿命的机制。转录水平的调控是重要的调控水平,真核生物在转录水平上的调节主要是通过反式作用因子、顺式作用元件和RNA聚合酶的相互作用来完成的。当反式作用因子和顺式元件结合后,将影响转录起始复合物的形成,从而影响转录的起始和效率。

5.分别说出7中以上RNA的功能

(1)RNA作为病毒基因组。在有些病毒中不含DNA,而是以RNA作为遗传信息的携带者。

(2)RNA在蛋白质生物合成中起重要作用。mRNA起信使和模板的作用,tRNA起转运氨基酸和信息转换的作用,rRNA起核糖体装配和催化的作用。

(3)RNA参与转录后加工、编辑和修饰。RNA转录后加工、编辑和修饰依赖于各类小RNA和其蛋白质复合物。

(4)RNA具有重要的催化功能和其它持家功能。

(5)RNA对基因表达和细胞功能具有重要调节作用,如RNA干扰。

(6)RNA在生物进化中起重要。作用核酶可以自身切割、剪接,切割其它RNA,合成肽键。

(7)非编码RNA是一类不编码蛋白质但具有功能的RNA分子,它们在生物体重要生命活动中发挥着极广泛的调控作用。

6.以乳糖操纵子为例画图说明原核基因的组织方式,操纵子的正调控和负调控。

操纵子的基本组成(组织方式):

结构基因群:乳糖操纵子含有lacZ、lacY和lacA 3个结构基因。lacZ基因编码β-半乳糖苷酶,将乳糖分解为半乳糖和葡萄糖;lacY基因编码半乳糖转移酶,使环境中的乳糖进入细胞内;lacA编码半乳糖苷乙酰基转移酶,消除lacY对细胞造成的毒性。

启动子区:操纵子至少有一个启动子,一般在第一个结构基因5'侧上游,控制整个结构基因群的转录。

操纵区:部分序列与启动子序列重叠。阻遏蛋白与操纵区结合,就妨碍了RNA聚合酶与启动子的结合及其后基因的转录起始,从而阻遏了lac基因的表达。

lacI基因:lacI的产物称为lac阻遏蛋白,与操纵区结合后能减弱或阻止其调控的基因转录。CAP位点:被cAMP活化的CAP与CAP位点结合,可以使得转录效率大幅提高。

操纵子的正调控和负调控。

lacI基因在其自身的启动子Pi控制下,低水平、组成性表达产生阻遏蛋白R,R与操纵子o结合,阻碍了RNA聚合酶与启动子Plac的结合,阻止了基因的转录起动。R的阻遏作用不是绝对的,R与o偶尔解离,使lac基因得以转录。

当有乳糖存在时,乳糖受β-半乳糖苷酶的催化转变为别乳糖,与R结合,使R失去与o的亲和力,与o解离,从而解除了阻遏蛋白的作用,基因转录开放。

当葡萄糖存在时,降低了cAMP的浓度,使得CAP无法与CAP位点结合,基因转录无法高效进行。

7.如果一种突变的菌株合成的σ因子与核心酶不易解离,对RNA合成可能产生什么影响? RNA聚合酶全酶与DNA模板的结合比核心酶紧密得多。RNA合成起始之后,突变的σ因子不能及时解离,极大地降低了RNA聚合酶沿模板移动的速度。因此该突变株的RNA合成比野生型慢得多。

2.简述真核生物和原核生物mRNA转录过程在启动子结构、启动子识别、转录终止和转录后加工方面的差异。

(1)原核生物mRNA以多顺反子的形式存在,真核生物mRNA一般以单顺反子形式存在。真核生物mRNA有5'端帽子结构和3'端的Poly(A)尾巴,真核细胞的前mRNA有许多内含子(会被加工剪接为成熟的mRNA)。

(2)原核生物中RNA聚合酶可以直接起始转录合成RNA,真核生物则不能。在真核生物中,三种RNA聚合酶都必须在蛋白质转录因子的协助下才能进行RNA的转录。

(3)原核细胞转录终止需要一种终止因子ρ的帮助。真核DNA转录单元的3'端均含富含有AT的序列,在相隔0~30bp之后又出现TTTT顺序(通常是3~5个T),这些结构可能与转录终止或者与3'端添加多聚A顺序有关。

(4)原核生物mRNA的转录与翻译一般是偶联的,真核生物转录的mRNA前体需经过转录后加工,加工为成熟的mRNA与蛋白质结合生成信息体后才开始翻译。

(5)原核生物mRNA半衰期短。真核生物mRNA的半衰期较长。

3.简述真核生物和原核生物蛋白质翻译过程在mRNA结构、起始密码子识别方面的差异。

结构:原核生物mRNA一般5'端有一段不翻译区,3'端有一段不翻译区,中间是蛋白质的编码区,一般编码几种蛋白质。真核生物mRNA(细胞质中的)一般由5'端帽子结构、5'端不翻译区、翻译区(编码区)、3'端不翻译区和3'端Poly(A)尾巴构成。真核生物mRNA通常都有相应的前体。从DNA转录产生的mRNA前体经过加工为成熟的mRNA。

起始密码子识别:(1)真核生物核糖体是80S(40S+60S);起始因子种类多;起始氨酰-tRNA不需甲酰化,mRNA没有SD序列;mRNA在小亚基上需5'端帽子结构和帽结合蛋白;mRNA先于氨酰-tRNA结合到小亚基上.(2)原核生物核糖体是70S(30S+50S);起始因子种类少;起始氨酰-tRNA需甲酰化;有SD序列;小亚基与起始氨酰-tRNA结合后,才与mRNA结合.7.请结合自己所在实验室的研究工作,说明分子生物学在本专业领域的应用。

在分子水平上研究生命现象的科学。通过研究生物大分子(核酸、蛋白质)的结构、功能和生物合成等方面来阐明各种生命现象的本质,如遗传信息的传递,基因的结构、复制、转录、翻译、表达调控和表达产物的生理功能,以及细胞信号的转导等。

分子生物学理论及技术在各个研究过程中具有重要作用,例如PCR技术。在实验中PCR技术主要用于在生物体外扩增特定的DNA片段,鉴定目的条带等,这种方法简便、快速。

PCR主要由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:①模板DNA的变性:使模板DNA双链解离为单链,以便与引物结合;②模板DNA与引物的退火:模板DNA经加热变性成单链后,降低温度使引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链,重复循环变性--退火--延伸三个过程就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需2~

4分钟,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。从而可以用电泳进行

真核生物:翻译与转录不偶联,mRNA在核内合成、经加工修饰到胞液指导蛋白质合成,mRNA半寿期约4-6小时(最短1小时,最长48小时)较稳定,易分离。mRNA为单顺反子,只有一个起始及一个终止点,一个mRNA分子只合成一种蛋白质;中间有内含子。(插入顺序)需加工剪掉;起始与肽链延长均需要GTP和 ATP。延伸阶段GTP水解后可被ATP再磷酸化,两种延伸因子可同时与核蛋白体结合,GTP水解后EF-1不掉下来无mRNA 时小亚基先与起始甲酰蛋氨酰,只有一种终止因子,为二聚体,能识别终止密码并与GTP相互作用。合成速度慢。

原核生物:翻译与转录偶联,边转录,边翻译,边降解。mRNA半寿期1-3分钟,不稳定,不易分离。为多顺反子,一个mRNA分子合成几种 蛋白质,需要GTP,?GTP水解后EF-Tu从核蛋白体上掉下来。有三种终止因子。合成速度快。

3.蛋白翻译是怎么终止的?

蛋白质翻译的基本过程为:识别、水解、解离

肽链的延伸过程中,当终止密码子出现在核糖体的A位时,没有相应的AA-tRNA能与之结合,而释放因子能识别这些密码子并与之结合,水解P位上多肽链与tRNA之间的二酯键。接着,新生的肽链和tRNA从核糖体上释放,核糖体大、小亚基解体,蛋白质合成结束。

7.简要说明沉默突变、致死突变、渗漏突变、进化突变的原因

⑴沉默突变:主要因为密码子的简并性,点突变不引起氨基酸的变化;或者个别氨基酸改变为结构和性质相似的氨基酸,则不影响表形,即基因型(genotype)改变表现型(phenotye)不变。⑵致死突变:关键氨基酸改变,如酶的活性中心突变,或者发生无义突变,使编码的蛋白质功能丧失,影响生物存活。

⑶渗漏突变:某个氨基酸改变,但基因产物并无重大改变,如酶的Km和Vmax改变。可使生物适应环境或丧失某些功能,可产生新种。

⑷进化突变:发生了有利于物种生存的结果,使生物进化。

9.DNA复制中都包括那些酶系统和蛋白因子,这些酶在复制中的各自作用是什么?是通过那些试验现象发现的?

(1)解旋酶:DNA复制时,解旋酶在ATP的作用下可促使DNA母链不断解开形成单链;

单链DNA结合蛋白:防止单链DNA形成发卡结构,保持伸展状态,保护单链DNA不被水解; DNA拓扑异构酶I:使DNA磷酸二酯键单链断裂断裂,形成DNA nick,使DNA可以旋转以释放解链时的张力;

DNA拓扑异构酶II:使DNA复制完毕后“互锁”的两个子代环状DNA解离;

引物酶:引物酶以单链DNA为模板,利用核糖核苷酸合成RNA作为DNA合成的引物;

DNA聚合酶I的功能a.5'→3'聚合作用,b.3'→5'外切酶活性(校对作用),c.5'→3'外切酶活性(切除修复作用);

DNA聚合酶III的功能:主要是合成新的DNA链;

DNA聚合酶II的功能:主要与修复有关;

DNA连接酶,借助ATP水解提供的能量,催化DNA单链nick的5'-端与3'-端生成磷酸二酯键。⑵DNA聚合酶I:可以用dNTP合成DNA链,并且该酶突变使菌易受环境影响而突变;

DNA聚合酶III:DNA聚合酶I的合成速度不能满足菌生长的需要,并且DNA聚合酶I突变的菌仍然可以复制DNA;引物酶:通过以а-32p-NTP标记+未标记dNTP为底物,引发合成后用稀碱处理,水解DNA和RNA的连接处,使RNA上的32p转移到了DNA上,证明RNA为引物,从而发现引物酶。

1.生物体内DNA重组的类型,各自的不同和生物学意义。

⑴同源重组:真核生物减数分裂过程中,染色体间的物质交换,即DNA分子的断裂和在重组酶作用下的交换连接;细菌没有减数分裂,同源重组发生在接合过程中;重组修复中也发生同源重组。

位点专一性重组:在专一酶作用下,在DNA特定位点上发生断裂和重接,从而产生精确的DNA重排的DNA重组方式。

转座重组:转座子在基因的许多位点间反复插入而实现的重组。

何谓转座子?转座子有哪些类型,研究转座重组有哪些意义?

⑴定义:能够反复插入到基因中许多位点的特殊DNA片段,它们可以从一个位点转移到另一个位点,从一个复制子到另一复制子。

⑵分类:简单转座子(插入序列IS,可独立存在的单元,带有介到自身移动的蛋白;复合转座子,除转座酶基因外,还带有其他功能性基因的转座子,通常是两端为两个简单转座子,中间夹带一个基因片段。

⑶研究意义:a.了解进化意义;b.为细胞分化发育提供理论依据;c.有助研究基因调控机制。

2.设计试验证明某一突变是调节基因突变或操纵基因突变。

⑴实验设计:将正常细胞和突变型细胞融合成杂合二倍体,并使其处于无诱导物的条件下,测定结构基因的表达情况。若其结果无组成型合成,则说明一定是调节基因突变;若有组成型合成,则是操纵基因突变。

⑵原理:若调节gene突变,则其中正常染色体可合成活性阻遏蛋白,与正常及突变染色体上的操纵基因结合,阻遏结构基因表达。

若操纵基因突变,则调节基因产生的阻遏蛋白虽有活性,但是不能于操纵基因结合,因而不能阻遏结构基因表达。

7.说明色氨酸操纵子的正负调控

简单的说,就是通过RNA的二级结构对翻译进行调控:

该操纵子位于MRNA的前导序列内,前导序列有4个位点1、2、3、4,他们1和2,2和3,3和4之间都能形成互补配对的2级结构。而基因的核糖体结合位点位于区域4。前导序列1能编码一段前导肽,该位点内有连续的2个色氨酸密码子,当高浓度色氨酸存在时,可以为该位点提供充足的翻译原料,核糖体可以顺利通过区域1,停留在区域2上,此结构导致区域1和2不能互补配对,而3和4配对,导致4区域的核糖体结合位点被屏蔽,以至于无法翻译基因信息。

而当细胞内色氨酸缺乏时,没有足够的翻译原料,核糖体停留在1位点,暴露2位点,这样2和3就互补配对形成2级结构,从而导致4位点暴露,从而开启核糖体结合位点,使基因得以表达。

8.简述氨基酸合成型操纵子的共同特点

⑴氨基酸合成型操纵子的前导区序列都可以形成衰减子结构。

⑵影响形成“茎环结构”或“poly u”结构的突变都会降低衰减子的作用,增加结构基因的表达。⑶前导区特异密码子突变成其他密码子,则衰减子只能起到终止作用。

⑷衰减子调控中需要翻译,利用原核生物转录和翻译几乎同时进行的特点。

⑸都属于一种反馈抑制的模式,合成的终产物抑制基因表达。

真核基因启动子的结构特点,已知某一基因受热激表达,试设计一个实验克隆其启动子,并研究其结构。

原核生物启动子序列包括:CAP序列,增强聚合酶的结合和转录的起始序列(-70~-40);识别区(-35);解旋区(-10);转录起始位点(+1)

真核启动子包括:核心启动子:其中包括转录起始位点或起始子(+1)及转录起始位点上游-25/-30bp处富含TA的TATA框。

上游启动子元件:包括通常-70bp附近的CAAT框和GC框等。

⑴可以以cDNA为核心,有内切酶消化cDNA两侧序列,自身环化,设计何时的引物扩增cDNA旁侧序列,寻找启动子区。

⑵对启动子的研究,通常是将启动子连接到报告基因上,然后用缺失、突变、插入等手段研究改变后的启动子的活性变化,进而推知启动子上潜在的顺式元件。

转座子序列特征

DNA转座子:终端反向重复序列,转座酶基因;类病毒转座子:两端长反向重复序列,整合酶和反转录酶基因;非病毒转座子:两端在5'UTR和3'UTR内,其间有两个基因,RNA结合酶,一个同时有反转录酶和核酸内切酶功能的酶。

为什么原核生物的基因调控大多采用转录抑制调控,而真核生物采用转录激活?

因为原核的转录较简单,步骤较少,采用抑制的方式效率较高,真核的转录较复杂,步骤较多,采用激活的方式效率较高。

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