进化分析步骤_进化树分析步骤

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1）BioXM2.6 查找前后引物，去掉载体序列，进行BLAST下载Genbank中的同源

序列，整理成.txt文档。BioEdit 对序列进行剪切编辑。

2）ClustalX 软件载入序列，进行完全比对/MEGA5 软件导入序列，进行ClustalW

序列比对，保存.max文件。

3）MEGA5比对结束后，查找最适宜的进化树分析方法，J&C、T92 or T93+G,选

择合适的方式进行建树。ML/NJ，设定 boottrap 500/1000。

4）

5）

MEGA5图片初步处理，调整次级分支的位置，保存为.nex/.tree/.txt文件 用Dendroscope图像处理软件打开.nexus/.nexml进行图片编辑。