snp样本准备指南_s参数snp格式详解

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1SNP检测样本准备指南

一、目的及适用范围

 本指南主要是向客户说明采用我公司的SNPstream系统和BeadArrayTM微珠

芯片技术进行SNP检测时，样本准备阶段需要遵循的一般原则、注意事项等，本指南适用于所有使用本公司SNP检测系统进行SNP检测的客户、协作和合作方。本公司建议具备提取DNA技术的客户自己提供符合要求的DNA样本。

二、样本准备应该遵循的基本原则

 代表性原则：取样的代表性关系到实验结果是否具有科学意义，因此您应该

根据实验目的慎重选择您的取样方案。病变组织样本中应不夹带正常组织，正常组织样本中不能含有病变组织。

 同一性原则：请客户在提供给我方DNA的同时应自己保留一份相同标识相同

内容的DNA，以便发生问题时双方对结果进行验证。

三、SNP检测的样本类型和量

 客户提供的DNA样本量必须符合以下条件：

SNPstream系统：DNA质量至少为50ng，DNA浓度至少为2ng/ul，DNA溶于双蒸水或TE中。

BeadArrayTM微珠芯片技术：DNA质量至少为500ng，DNA浓度至少为50ng/ul，DNA溶于双蒸水或TE中。

 对于提供组织、血样等非核酸类型样本的客户，可以委托本公司进行DNA提

取（费用另计）。请尽量提供足量、新鲜、标识清晰的样本。

 客户与公司签订服务合同并付预付款后，将样本（附样本登记单）直接或委

托客户工程师送至本公司商务中心，样本质检合格后我方技术服务平台将在合同规定的工作日内完成实验。

四、血液及其它科研样本采集操作建议流程（以SNPstream系统为例）

 血样（推荐）：0.3毫升枸橼酸钠抗凝全血。

 1-2周内可收完样品，可将抗凝血置于4oC冰箱保存；

 如需较长时间收集样本，可将抗凝血置于-20oC保存，至少2年内可用。 血清：（研究血清中的DNA病毒等DNA样本，为了减少样本基因组DNA干

扰，可分离血清）至少0.2毫升血清样本,-20oC保存，至少1年内可用。

 口腔拭子：用本公司提供的口腔拭子样品收集袋，严格遵循袋内提供的指导

2说明进行，样品置-20oC保存，至少1年内可用。

 脑脊液：取样至少400ul置于1.5ml离心管，-20oC保存。

 生殖道拭子：将拭子置于含350ul生理盐水的2ml离心管中，反复转动，洗脱

样本，在管壁挤压拭子滴干水分后抛弃拭子，置-20oC保存。

 石腊切片等其他样本：联络我方技术部门，在我们建议下收集。

五、DNA样本制备操作建议流程

 DNA提取的注意事项

1.建议客户使用成熟商业试剂盒抽提全基因组 DNA（推荐使用QIAGEN公

司试剂盒）；建议客户送样时提供保存于TE或双蒸水中的DNA样本，并在样本登记单上说明保存介质；

2.建议客户送样时提供DNA样本的电泳图谱以及相关的OD值等实验数据。

DNA样本完全干燥后很难溶于水，因此不要提供干燥状态的DNA样本；

3.如果经质检证明DNA样本无法继续实验时，商务中心将及时与客户联系，协商进一步处理事宜。

 DNA质量判定标准

以本公司对样本进行OD260、OD260/OD280检测定量，达到样本浓度、纯度

及总量的样本再抽样进行质检及引物PCR实验，结果阳性为合格。

由于中间环节中不确定因素的存在，DNA样本的质量以我公司质检部检测

结果为准。