氯仿法提取DNA_氯仿法提取dna

2020-02-27 其他范文 下载本文

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试验原理:

苯酚/氯仿提取DNA是利用酚是蛋白质的变性剂,反复抽提,使蛋白质变性,SDS(十二烷基磺酸钠)将细胞膜裂解,在蛋白酶K、EDTA的存在下消化蛋白质或多肽或小肽分子,核蛋白变性降解,使DNA从核蛋白中游离出来。DNA易溶于水,不溶于有机溶剂。蛋白质分子表面带有亲水基团,也容易进行水合作用,并在表面形成一层水化层,使蛋白质分子能顺利地进入到水溶液中形成稳定的胶体溶液。当有机溶液存在时,蛋白质的这种胶体稳定性遭到破坏,变性沉淀。离心后有机溶剂在试管底层(有机相),DNA存在于上层水相中,蛋白质则沉淀于两相之间。酚-氯仿抽提的作用是除去未消化的蛋白质。氯仿的作用是有助于水相与有机相分离和除去DNA溶液中的酚。抽提后的DNA溶液用2倍体积的无水乙醇在1/103mol/LNaCl存在下沉淀DNA,回收DNA用70%乙醇洗去DNA沉淀中的盐,真空干燥,用TE缓冲液溶解DNA备用。试验步骤:

1、将1mlEDTA抗凝贮冻血液于室温解冻后移入5ml离心管中,加入1ml磷酸缓冲盐溶液(PBS),混匀,3500rpm离心15min,倾去含裂解红细胞的上清。重复一次。用0.7mlDNA提取液混悬白细胞沉淀,37℃水浴温育1h。

2、将上述DNA提取液混悬白细胞,37℃水浴温育1h后,加入1mg/ml蛋白酶K0.2ml,至终浓度为100-200ug/ml,上下转动混匀,液体变粘稠。50℃水浴保温3h,裂解细胞,消化蛋白。保温过程中,应不时上下转动几次,混匀反应液。

3、反应液冷却至室温后,加入等体积的饱和酚溶液,温和地上下转动离心管5-10min,直至水相与酚相混匀成乳状液。5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复酚抽提一次。加等体积的氯仿﹕异戊醇(24﹕1),上下转动混匀,5000rpm离心15min,用大口吸管小心吸取上层粘稠水相,移至另一离心管中。重复一次。

4、加入1/5体积的3mol/LNaAc及2倍体积的预冷的无水乙醇,室温下慢慢摇动离心管,即有乳白色云絮状DNA出现。用玻璃棒小心挑取云絮状的DNA,转入另一1.5ml离心管中,加70%乙醇0.2ml,以5000rpm离心5min。洗涤DNA,弃上清,去除残留的盐。重复一次。室温挥发残留的乙醇,但不要让DNA完全干燥。加TE液20ul溶解DNA,置于摇床平台缓慢摇动,DNA完全溶解通常需12-24h。制成的DNA液-20℃冰箱保存备用。

组成浓度:10mM Tris-HCl 1mM EDTA PH=8.0 配制量:500ml 配制方法:量取下列溶液于500ml烧杯中 1M Tris-HCl Buffer PH=8.0 5ml 0.5M EDTA PH=8.0 1ml 向烧杯中加入约400mldd H2O均匀混合;将溶液定容到500ml后,高温高压灭菌;室温保存.称82克乙酸钠溶于适量水中,加入60克冰乙酸,然后转移到1000毫升的容量瓶中,用少量水洗涤烧杯2到3次,洗液并入容量瓶中,再定容到刻度线即可。

磷酸盐缓冲液(Phosphate Buffer, PB)

试剂: NaH2PO4•2H2O

Na2HPO4•12H2O

配制方法:配制时,常先配制0.2mol/L的 NaH2PO4和0.2mol/L的Na2HPO4,两者按一定比例混合即成0.2mol/L的磷酸盐缓冲液(PB),根据需要可配制不同浓度的PB和PBS。(1)0.2mol/L的 NaH2PO4;称取NaH2PO4.2H2O 31.2g(或 NaH2PO4•H2O 27.6g)加重蒸水至1000ml溶解。

(2)0.2mol/L的Na2HPO4:称取Na2HPO4.12H2O 71.632g(或 Na2HPO4•7H2O 53.6g或 Na2HPO4•2H2O 35.6g)加重蒸水至1000ml溶解。

(3)0.2mol/L pH7.4的PB的配制:取19ml 0.2mol/L的 NaH2PO4和81ml 0.2mol/L的 Na2HPO4•12H2O,充分混合即为0.2mol/L的PB(pH约为7.4~7.5)。若pH偏高或偏低,可通过改变二者的比例来加以调整,室温保存即可。0.2mol/L磷酸盐缓冲液(pH5.7~8.0)

pH 0.2mol/L NaH2PO4(ml)0.2mol/L Na2HPO4(ml)5.7

93.5

6.5 5.8

92.0

8.0 5.9

90.0

10.0 6.0

87.7

12.3 6.1

85.0

15.0 6.2

81.5

18.5 6.3

77.5

22.5 6.4

73.5

26.5 6.5

68.5

31.5 6.6

62.5

37.5 6.7

56.5

43.5 6.8

51.0

49.0 6.9

45.0

55.0 7.0

39.0

61.0 7.1

33.0

67.0 7.2

28.0

72.0 7.3

23.0

67.0 7.4

19.0

81.0 7.5

16.0

84.0 7.6

13.0

87.0 7.7

10.5

89.5 7.8

8.5

91.5 7.9

7.0

93.0 8.0

5.3

94.7

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