实验四动物血液中DNA的提取教案_实验动物的取血方法

2020-02-27 教案模板 下载本文

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授课教师常祖明学生人数 55

课题血液基因组DNA的提取

授课类型新授课授课方法讲授、演示 教学用具多媒体、实验室设备

教学目的掌握鸡血DNA提取的原理及方法

教学重点理解实验过程中每一步操作的目的及原理 教学难点 教学过程

一、实验目的1.掌握鸡血DNA提取的原理;

2.掌握鸡血DNA提取的方法及操作过程。

二、实验原理

哺乳动物的成熟红细胞已经高度分化,因而当中没有细胞核,无法提取DNA。禽类的血细胞则可以。禽类代谢旺盛,血液中红细胞更多,而且红细胞中有完整的细胞核、大量的染色体。且材料易得、经济。用鸡血细胞做实验材料有两个原因。一是因为鸡血细胞核的DNA含量丰富,材料易得;二是鸡血细胞极易吸水胀破,而用动物肝脏细胞作实验材料常常需要匀浆和离心,对设备要求较高,操作繁琐,历时较长。

三、实验仪器 1.水浴锅:55℃

2.离心机:8000转、12000转 3.离心管:5ml(120个)

4.移液枪:10μl、680μl、700μl、800μl、900μl、1ml 5.容量瓶:100ml 6.取血针及管

四、实验材料及药品

实验材料:普通家鸡:需血液4.08ml(每管136(l)1.无水乙醇

作用:DNA沉淀剂、洗涤剂。

商品信息:瓶/500ml,分析纯AR。

理化性质:无色澄清液体。有灼烧味。易流动。极易从空气中吸收水分,能与水和氯仿、乙醚等多种有机溶剂以任意比例互溶。

储存:储存于阴凉、通风的库房。远离火种、热源。库温不宜超过30℃。保持容器密封。应与氧化剂、酸类、碱金属、胺类等分开存放,切忌混储。采用防爆型照明、通风设施。禁止使用易产生火花的机械设备和工具。

危害:易燃,具刺激性。蒸气与空气能形成爆炸性混合物,爆炸极限3.5%~18.0%(体积)。2.柠檬酸

作用:ACD抗凝血剂成分之一。在抗凝剂中,中和柠檬酸钠的碱性。商品信息:分析纯AR,白色塑料瓶/500g,理化性质:无臭,有很强的酸味,白色粉末或颗粒,易溶于水和醇。在潮湿的空气中微有潮解性。

储存:在湿空气中有轻微潮解,需阴凉密封干燥保存。

危害:柠檬酸浓溶液对黏膜有刺激作用。柠檬酸可燃。粉体与空气可形成爆炸性混合物,遇明火、高热或与氧化剂接触,有引起燃烧爆炸的危险。3.柠檬酸钠

作用:ACD抗凝血剂成分之一。能与血液中的钙离子结合成螯合物,而使钙离子失去凝血作用,从而阻止血液凝固。

商品信息:柠檬酸三钠分析纯500克/瓶。

理化性质:有机化合物,外观为白色到无色晶体。无臭, 有清凉咸辣味。常温及空气中稳定, 在湿空气中微有溶解性, 在热空气中产生风化现象。加热至150℃失去结晶水。易溶于水、可溶于甘油、难溶于醇类及其他有机溶剂,过热分解,在潮湿的环境中微有潮解,在热空气中微有风化,其溶液 pH 值约为8。储存: 常温密闭保存 危害:无毒 4.尿素

作用:禽血裂解液成分之一。尿素能非常有效地使蛋白质变性,尤其能非常有效地破坏非共价键结合的蛋白质。

商品信息:化学试剂分析纯 500克/瓶(塑料瓶装)理化性质:无色柱状结晶或白色结晶性粉末,溶于水,乙醇和苯,难溶于乙醚,不溶于氯仿。储存:密封避光保存。

危害:避免与皮肤和眼睛接触。5.十二烷基硫酸钠(SDS)作用:禽血裂解液成分之一。裂解核酸-蛋白质复合体,用于从蛋白质中分离核酸。商品信息:500g/分析纯AR。

理化性质:白色或淡黄色粉末。溶解性:溶于水,呈透明溶液,溶液呈中性。易溶于热水,溶于水,溶于热乙醇,微溶于醇,不溶于氯仿、醚。储存:密封阴凉干燥保存 防止受潮受热 危害:对粘膜和上呼吸道有刺激作用,对眼和皮肤有刺激作用。可引起呼吸系统过敏性反应。该品可燃,具刺激性,具致敏性。遇明火、高热可燃。受高热分解放出有毒的气体。6.1M Tris-HCl(PH8.0)缓冲液

作用:禽血裂解液成分之一。提供一个缓冲环境,防止DNA被破坏 商品信息:瓶/100ml,无色、澄清溶液

理化性质:Tris中文品名为三羟甲基氨基甲烷,瓶/500g。是一种白色结晶或粉末。溶于乙醇和水,微溶于乙酸乙酯、苯,不溶于乙醚、四氯化碳,对铜、铝有腐蚀作用,有刺激性的化学物质。

储存:室温保存。

危害:毒性低,可致癌,不要直接接触皮肤。7.乙二胺四乙酸二钠(EDTA-2Na)

作用:配制0.5M EDTA(PH8.0)溶液。螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制脱氧核糖核酸酶(DNase)活性,活性依赖于钙离子,并能被镁离子或二价锰离子激活。商品信息:瓶/250g。理化性质:无味无臭或微咸的白色或乳白色结晶或颗粒状粉末。溶于水,不溶于乙醇、乙醚,其水溶液pH值约为5.3。可由EDTA与氢氧化钠和碳酸钙作用制得。

储存:于阴凉、通风的库房。远离火种、热源。应与氧化剂分开存放,切忌混储。配备相应品种和数量的消防器材。储区应备有合适的材料收容泄漏物。

危害:对粘膜和上呼吸道有刺激作用。对眼睛、皮肤有刺激作用。本品可燃,具刺激性。8.蛋白酶K(共需300μl,每管10μl)作用:消化组蛋白,释放出DNA;消化DNase,提高DNA产量 商品信息:(20mg/mL)1ml/支。

理化性质:一种枯草蛋白酶类的高活性蛋白酶,从林伯氏白色念球菌中纯化得到。储存:保存在-20℃冰箱里,避免反复冻融,有效保证12月。危害:使用时注意不要接触皮肤,以免损伤皮肤表面的蛋白质。9.Tris饱和酚(共需60ml,每管2ml)作用:强蛋白质变性剂。商品信息:瓶/250ml。理化性质:为浅黄色透明液体,上层为Tris-HCl溶液,加有抗氧化的0.25% 8-羟基喹啉和0.1%的β-巯基乙醇。

储存:4℃避光保存。

危害:Tris饱和酚有较强的腐蚀性,应尽量避免皮肤直接接触或吸入体内。如发现变为黄色或棕色,表明发生氧化,不能使用。10.氯仿(三氯甲烷)

作用:蛋白质变性剂,加速有机相与液相分层,去除核酸溶液中的迹量酚。商品信息:瓶/500ml。

理化性质:无色透明重质液体,极易挥发,有特殊气味。不溶于水,溶于醇、醚、苯。储存:保存在密封的棕色瓶中。

危害:麻醉性。有致癌可能性。在光照下遇空气逐渐被氧化生成剧毒的光气。11.异戊醇

作用:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。商品信息:瓶/500ml。

理化性质:无色液体,有不愉快的气味。微溶于水,可混溶于醇、醚等有机溶剂。

储存:储存于阴凉、通风的库房。远离火种、热源。库温不宜超过30℃。保持容器密封。应与氧化剂、酸类等分开存放,切忌混储。采用防爆型照明、通风设施。禁止使用易产生火花的机械设备和工具。储区应备有泄漏应急处理设备和合适的收容材料。

危害:吸入、口服或经皮肤吸收有麻醉作用。其蒸气或雾对眼睛、皮肤、粘膜和呼吸道有刺激作用,可引起神经系统功能紊乱,长时间接触有麻醉作用。易燃,其蒸气与空气可形成爆炸性混合物,遇明火、高热能引起燃烧爆炸。12.无水葡萄糖

作用:ACD抗凝血剂成分之一。商品信息:500g/瓶。

理化性质:无色结晶或白色结晶性粉末;无臭、味甜。水中易溶,在乙醇中微溶。储存:无水葡萄糖易吸水结块,因此应密封保存。危害:无。

五、实验试剂 1.75%的乙醇

{75ml + 25ml水} → 100ml75%的乙醇

2.ACD抗凝剂 100ml(共需48ml,每管0.8ml)

{柠檬酸0.48g + 柠檬酸钠1.32g + 葡萄糖1.47g} →加水至100ml,灭菌后备用。3.禽血裂解液 100ml(共需51ml,每管1.7ml)

{尿素12g + SDS 1g + 1M Tris-HCl(PH8.0)10ml + 0.5M EDTA(PH8.0)20ml} →加水定容至100ml,备用。

【0.5M EDTA(PH8.0)】的配制:100ml {水80ml + EDTA-2Na 18.61g} →用NaOH(约2g)调至PH8.0 →定容至100ml →分装后高压灭菌备用。注:需加入NaOH调至PH8.0才能完全溶解。4.氯仿-异戊醇(24:1)共需54ml,每管1.8ml {氯仿 96ml + 异戊醇 4ml} = 100ml,4℃保存

5.酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)共需60ml,每管2ml {氯仿-异戊醇(24:1)40ml + Tris饱和酚40ml} = 80ml,4℃保存 6..TE缓冲液 PH8.0 50ml {10mM Tris-HCl(PH8.0)缓冲液 0.5ml + 0.5M EDTA(PH8.0)0.1ml} → →定容到50ml →高压灭菌后冷却4℃保存 【0.5M EDTA(PH8.0)】的配制:100ml {水 80ml + EDTA-2Na 18.61g} →用NaOH(约2g)调至PH8.0 →定容至100ml →分装后高压灭菌备用。注:需加入NaOH调至PH8.0才能完全溶解。【10mM Tris-HCl(PH8.0)缓冲液】的配制:10ml {1M Tris-HCl PH8.0缓冲液100μl + 水9.9ml} →定容至10ml → 10mM Tris-HCl(PH8.0)缓冲液

六、实验步骤

1.采用翅静脉采血,抽取血液5mL,溶于20mL 75%的乙醇中,振荡混匀,配成家鸡血样25ml(酒精:血=4:1)目的:乙醇可以抑制DNA水解酶的活性,防治DNA降解,并且75%有防止血液凝固的作用。75%乙醇效果比无水乙醇效果好,血样不至于太干涩。酒精:血(4:1)混合的血样保存时间长,可达4个月。

2.取血样(酒精:血=4:1)680(L至5mL离心管中,8000转离心1分钟,弃上清; 目的:去除血样中大部分的乙醇,保证后面蛋白酶K的活性。

3.加800(LACD摇匀,8000转离心1分钟,弃上清;再加800(LACD摇匀,8000转离心1分钟,弃上清;

目的:ACD抗凝剂可以螯合血液中的钙离子,防治血细胞凝集成团凝固,影响血细胞的破碎和对血细胞里DNA的提取。多次离心可以去除血样中的乙醇,保证后面蛋白酶K的活性。4.加1700(L裂解液,10(L蛋白酶K(100(g),摇匀,55℃水浴保温过夜; 目的:DNA裂解液的作用是破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离,抑制细胞中DNase的活性;而蛋白酶k的作用是将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来,蛋白酶k还可以消化DNAse,提高DNA产量。55℃水浴保温过夜可以让蛋白酶K充分发挥作用。

5.加2mL饱和酚,摇匀至无块状物,12000转离心10分钟;

目的:饱和酚是强蛋白质变性剂,可以将蛋白质及降解后的产物充分变性,变性后的蛋白质溶解度减低,易沉淀。

6.吸取上层透明的DNA溶液至另一5mL离心管中,注意不要搅拌下层的酚-蛋白层;

目的:加入饱和酚后溶液分层,上层是透明的DNA溶液,再往下是变性的蛋白质,饱和酚的比重最大在最下层。

7.加2mL酚-氯仿-异戊醇(25:24:1),摇匀至悬浮液,12000转离心10分钟; 目的:加入酚-氯仿-异戊醇进一步去除DNA溶液中的残留蛋白质。

8.吸取上层DNA液于另一5mL离心管中,加1.8mL氯仿-异戊醇溶液,摇匀,12000转离心10分钟; 目的:由于酚与水有部分混溶,DNA水溶液中会混有部分酚,由于氯仿和酚互溶而不溶于水,用氯仿-异戊醇在抽提一次可以把酚带走。

9.吸取上层DNA液900(L于另一5mL离心管中,加无水乙醇至满,颠倒混合,试管中出现白色团块,即是DNA;

目的:DNA水溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇与DNA不相溶但与水相溶,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合收集。用无水乙醇的目的是乙醇中如果含有水,DNA会部分溶于水中,降低DNA沉淀的产量。

10.吸出试管中的无水乙醇,加75%的乙醇,混合,吸出75%的乙醇,重复2次;

目的:像前面步骤中加入的抗凝血剂中的柠檬酸钠、葡萄糖,裂解液中的SDS、EDTA-2Na,在氯仿及醇中的溶解度低,经乙醇沉淀后的DNA中会有以上杂质存在。以上杂质有个共同的特征就是都易溶于水,故用75%的乙醇洗涤,可以利用其中的15%的水溶解这些杂质除去。11.将DNA自然晾干后溶入1000(L TE缓冲液,-20℃保存;

目的:乙醇已挥发除去,TE缓冲液一可以抑制Dnase活性,二维持一定碱性PH值,有助于DNA的溶解和稳定。

七、实验注意事项

1.在整个实验过程中应严格执行无菌操作; 2.部分药品有毒,操作中应注意安全防护;

3.刚投入水浴时可以稍快速的晃动,之后的晃动一定要轻柔; 4.抽提时不要有太力振动,操作也要仔细,尽量避免DNA断裂;

5.吸出试管中的无水乙醇时用的枪头一定要剪过的,这点很重要,过尖的枪头会把DNA链弄断。

八、思考题

1.本实验中几次用到的不同浓度乙醇的作用是什么?

九、实验安排

全班55人,按照学号分组,每6人一组,共9组,最后一组7人。每组作3个离心管,共用一个研钵。

每3组(共18人9个离心管)共同进行离心操作。

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