课题2 多聚酶链式反应扩增DNA片段 教学设计 教案_多聚酶链式反扩增dna

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教学准备

1.教学目标

1、了解PCR技术的基本操作

2、理解PCR的原理

3、讨论PCR的应用

2.教学重点/难点

教学重点:PCR的原理和PCR的基本操作 教学难点:PCR的原理

3.教学用具

教学课件

4.标签

教学过程

(一)引入新课

回忆DNA分子的结构

1、组成元素:C、H、O、N、P2、基本单位: 脱氧核苷酸

3、脱氧核苷酸结构

(二)、细胞内的DNA复制

1、概念:由一个DNA形成两个完全相同的DNA的过程

2、时期:有丝分裂间期减数第一次分裂前的间期

3、场所:细胞核(主)、线粒体、叶绿体

4、模板:DNA母链

5、原材料:脱氧核苷酸

6、基本条件:酶、ATP、原料、模板

7、复制过程: ① DNA的解旋 ② RNA引物的合成③ DNA的生成 ④切掉引物生成冈崎片断 ⑤ DNA片断的连接

8、复制特点: 边解旋边复制(过程)、半保留复制(结果)

9、遵循原则:碱基互补配对原则

10、精确复制的原因:

①规则的双螺旋结构为复制提供了精确的模板 ②碱基互补配对能力保证了复制准确无误的进行

(三)、聚合酶链式反应

PCR是由美国科学家穆利斯提出的一种体外简化条件下模拟DNA体内复制的DNA快速扩增的方法,此技术获得1993年诺贝尔化学奖。

1.PCR原理

PCR技术扩增DNA的过程,与细胞内DNA复制过程类似: 1.1细胞内DNA复制条件分析:

1.2细胞内DNA复制过程

(1)DNA的反向平行结构:(结合教材图5-6)核苷酸分子的结构与方向性:(分子结构模式图)

由核苷酸通过3,5-磷酸二酯键连接形成核苷酸长链:(模式图,体现方向性)。DNA双螺旋结构的反向平行结构:(2)DNA的复制过程: 解旋:解旋酶、ATP,DNA两条链打开,形成两条DNA单链。

引物结合:在DNA单链3’端与DNA反向配对结合,确保引物3’端与DNA单链准确配对。

DNA聚合酶结合:

子链合成:DNA聚合酶从引物3’端开始,将配对的脱氧核苷酸连接起来。

后续加工:DNA聚合酶I将引物切去,并合成空缺处的DNA单链,再由DNA连接酶将不连续的DNA子链连接起来(半不连续合成。先导链,滞后链)

子链合成特点:不能从头合成;合成方向为“5’→3’合成”。

感悟生命的神秘:DNA聚合酶不但能够催化磷酸二酯键的形成,还具有校对功能。它在每引入一个核苷酸后都要复查一次,只有碱基配对无误后才能继续往下聚合,它不能从头合成。RNA聚合酶没有校对功能,因此RNA的合成不需要引物,而是从头合成的,它的错配可能性较大,在RNA引物完成功能后即被DNA聚合酶I删去,代之以高保真的DNA链。

[思考]DNA分子能准确复制的原因有哪些?

DNA双螺旋结构提供模板;碱基互补配对;DNA聚合酶的复查功能。[思考]细胞内哪些物质是从头合成的?RNA合成、蛋白质合成。1.3 DNA分子复制的人工控制

解开螺旋:在80~100℃时,DNA双螺旋打开,形成两条DNA单链,称为变性。恢复螺旋:在50℃左右时,两条DNA单链重新形成双螺旋结构,称为复性。复制条件:缓冲液,DNA模板,四种脱氧核苷酸,热稳定DNA聚合酶,两种引物。反应场所:PCR仪(自动温度周期性调节)。[思考]缓冲液相当细胞内的什么成分?(核基质)2.PCR的反应过程

变性:在95℃时DNA解旋

复性:在50℃时引物与DNA单链结合延伸:在72℃时合成DNA子链(两个引物间的序列)3.实验操作 3.1 PCR反应体系:

缓冲液、DNA模板,四种脱氧核苷酸原料、热稳定DNA聚合酶、两种RNA引物,水 3.2 实验操作步骤

3.3 按照PCR反应体系配方配制反应液;

(1)将PCR反应体系50μL用微量移液器转移到微量离心管(0.5mL)中;(2)将微量离心管放到PCR仪中;(3)设置PCR仪的工作参数。(4)DNA在PCR仪中大量扩增。

3.4 水浴法:将微型离心管依次在95℃、55℃、72℃的恒温水浴锅中循环处理相应时间。

4.实验注意事项

(1)避免外源DNA污染:所用仪器、缓冲液、蒸馏水等使用前高压灭菌。(2)缓冲液和酶分装成小份,-20℃低温保存。(3)每添加一种反应成分,更换一个移液器的枪头。(4)混匀后离心处理,使反应液集中在离心管底部。5.结果分析与评价

(1)反应液稀释:取2µLPCR反应液,添加98µL蒸馏水;2.分光光度计调零:将100µL蒸馏水添加到比色杯中,在260nm处将分光光度计调整读数为零。

(2)将100µL反应稀释液倒入比色杯中,测定在260nm处的光吸收值。(3)计算:DNA含量=50×光吸收值×稀释倍数

(四)、PCR产物鉴定: 琼脂糖凝胶电泳技术

1、实验原理

在外加电场的作用下,带电粒子发生迁移的现象叫电泳。在电场中,带电分子向着与其所带电荷相反的电极移动。

在施以一定强度的电场中,带负电荷的DNA在琼脂糖凝胶中可以由电源的负极向正极泳动,泳动的速度与DNA片段的长度成负相关,与电压强度成正比,利用这一性质可以分离不同长琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物:

(1)制胶(2)点样(3)电泳

(4)紫外投射分析仪观察并照相

2、两种染料:

6×上样buffer:维持反应体系的pH不变,而且上样buffer常以溴酚蓝为指示剂,稀释成1×后比重仍然较大,上样时极易下沉,且颜色清晰可见。

DNA荧光染料:由于DNA不能直接观察到,所以利用一种核酸的荧光染料与PCR的产物DNA结合后再电泳,电泳结束后,可用紫外透射分析仪观察电泳结果。

3、可以用已知长度的DNA “Marker”作为参照,对电泳图谱进行比对,估算未知DNA分子的长度,同时根据带的宽度,估算未知DNA分子的数目。

(五)、PCR的应用

PCR具有省时、操作简便、特异性强、灵敏度高、效率高、应用范围广等特点。PCR技术在分子生物学、医学和案件侦破等领域得到广泛应用。

课堂小结

PCR的技术,需要首先了解细胞内参与DNA复制的各种组成成分与反应条件。掌握PCR的基本步骤及每个步骤所发生的变化。这部分内容的应以读图识图为主。在现代生物技术中,DNA技术可谓是尖端技术。人类基因组计划、基因工程、基因诊断、基因检测、古生物鉴定等都离不开对DNA分子碱基序列的分析。而分析DNA碱基序列,就需要一定量的DNA片段。今天我们来学习研究了DNA分子的扩增技术――PCR技术。希望大家能够掌握和理解。

板书

专题五 第2节 多聚酶链式反应扩增DNA片段

一、细胞内的DNA复制

二、聚合酶链式反应

1、PCR扩增的原理

2、PCR扩增的过程

三、PCR产物鉴定 琼脂糖凝胶电泳技术

四、PCR的应用

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